给阎润涛解释为什么XylE是朝外的
文章来源: SwiperTheFox2019-08-04 02:43:40

阎润涛追着问"再说了,你就算把glut1看出是马,XlyE是斑马,你有过证据证明XlyE开口朝里朝外变形的生化数据吗?glut1没有,XlyE 也没有啊"

回答如下:

这个不需要生化数据. 知道N端与C端都是面向细胞内的(这是基本知识), 实在不知道的话,颜2014的paper里也写了: “XylE contains a typical MFS fold of 12 TMs, with amino and carboxy terminal both located on the intracellular side. " 。  根据这一拓扑性质,(至少可以追溯到1987年) 拿到了晶体结构一看就知道是朝里还是朝外的了。

颜宁2012做了与3个底物的XylE的晶体,晶体结构显示都是朝外的。 这是不需要生化数据的。 2014图5不是每个元素都需要生化数据。

拿到了2012XylE朝外的结构图,2014就先做个朝里的Glut1.  这是根据1997年的文献Schurmann的指点。

Schurmann, A. et al. Role of conserved arginine and glutamate residues on the
cytosolic surface of glucose transporters for transporter function. Biochemistry 36, 12897–12902 (1997).